Takhasus merupakan salah satu program khusus yang diselenggarakan MBS Yogyakarta untuk mempersiapkan kemampuan berbahasa santri, baik Bahasa Arab maupun Bahasa Inggris. Program ini diselenggarakan untuk membantu santri yang hendak melanjutkan jenjang SMA, namun kemampuan berbahasa Arab dan bahasa Inggris belum mencukupi. Program ini berlangsung selama satu tahun bersamaan dengan tahun pelajaran baru santri SMP dan SMA. Target yang diharapkan dari program ini adalah santri mampu berbahasa Arab dan Inggris secara verbal (aktif) maupun tertulis (pasif). Selama satu tahun santri akan belajar bahasa Inggris dan beberapa mapel berbahasa Arab, seperti Muthala’ah, Tamrin Lughoh, Shorof, Hadits, dll.